Ich habe vergleichbare Symptome am V6 - s. Thread "sporadisch auftretendes Rucken..." -, die sich auch über einen längeren Zeitraum entwickelten. Die Abgasrückführung war bei mir unschuldig, könnte aber in Deinem Fall in Betracht kommen. Ich würde versuchsweise die beiden Unterdruckleitungen am EGR-Unterdruckregler (kleines zylindrisches Teil, sitzt beim 4-Zyl gut zugänglich an der Spritzwand) abziehen und mit M5-Schrauben verschließen, um diese Ursache auszuschalten. Das kann man getrost über einen längeren Zeitraum tun.
Ich versuche es jetzt bei mir mit Zündkerzen, Zündkabeln und Zündspule. Aus Gründen der Vereinfachung alle Maßnahmen auf einmal, auch wenn das im Positivfall rückwirkend keine klare Diagnose erlaubt. Stay tuned.